สิ่งแทรกซ้อนซึ่งอาจเกิดได้จากผลการจัดฟัน สำหรับสิ่งแทรกซ้อนที่อาจเกิดขึ้นจากผลของการจัดฟันมีหลายประการด้วยกัน คนไข้ควรได้รับข้อมูลในส่วนนี้ก่อนเพื่อจะได้รับทราบถึงข้อจำกัดที่อาจจะเกิดขึ้นกับตนเองได้ ดังนี้ -ความยาวของรากฟันลดลง พบได้ในคนไข้บางรายเท่านั้น การจัดฟันอาจทำให้ความยาวของรากฟันลดลงในขณะจัดฟัน ซึ่งหากเกิดขึ้นก็ไม่ได้มีผลกระทบต่อประสิทธิภาพของการบดเคี้ยวอาหารแต่อย่างใด -การเกิดโรคฟันผุและโรคเกี่ยวกับเหงือก โดยส่วนใหญ่แล้วจะเกิดขึ้นกับคนไข้ที่ไม่ดูแลในการรับประทานอาหาร เช่น มักรับประทานอาหารที่มีน้ำตาลมากจนเกินไป หรือไม่ได้ทำความสะอาดฟันอย่างถูกวิธี ไม่ทำความสะอาดฟันอย่างสม่ำเสมอ เป็นต้น -การเคลื่อนฟัน อาจมีการเคลื่อนฟันในกรณีที่คนไข้มีการเรียงตัวของฟันที่ผิดปกติมากอยู่แล้ว ซึ่งการเคลื่อนฟันนี้มีผลกระทบต่อสุขภาพของกระดูกและเหงือกที่รองรับฟัน -เครื่องมือฟันหลุด อาจมีบางกรณีที่เครื่องมือจัดฟันหลุด และคนไข้เผลอกลืนลงไป อย่างไรก็ตามหากคนไข้รู้สึกถึงความผิดปกติ ว่ามีเครื่องมือหักหรือหลุดเกิดขึ้น ควรแจ้งทันตแพทย์ให้ทราบโดยเร็ว เพื่อให้แก้ไขได้อย่างทันท่วงที